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get 两个小工具,没有养不好的细胞
人阅读 发布时间:2018-03-15 11:31
前两天有同学在咨询病毒问题时,对细胞的形态以及培养条件都不是很清楚,悲剧的是要查询的细胞 ATCC 上要么没有,要么就没有相应的图片信息。这位同学还是个新手,对于细胞转染后的药物筛选也一无所知。
俗话说的好,工欲善其事,必先利其器,做细胞实验前,必须先了解细胞的特性,但 ATCC 数据库满足不了需求的时候怎么办?
相信很多同学也会有类似的烦恼,下面小编向大家推荐两个集成化的细胞数据库:ExPASy 和 Cell Culture Database。
1、ExPASy
链接:http://web.expasy.org/cellosaurus/
ExPASy 首页:
该数据库收录了 10 万 + 细胞系,主界面却像谷歌一样干净,很像老外的风格,简约不简单。当我们敲入所要查询的细胞信息时,以 NK-92 细胞为例,会得到如下界面:
正常我们要找的是 NK-92 细胞的野生型,也就是第一选项,其他亚种的培养条件以及倍增时间跟野生型的基本一致,因此我们点进去第一个选项即可:
以上是该细胞的身份信息以及培养时的注意点,似乎少了一些亮点,别着急,我们继续往下看:
Web pages 里面有相应的网页连接,可以查询 NK-92 细胞的维基百科,而第二个链接则是收藏该细胞的学术机构的网页,点击进入,里面有 4 种关于 NK-92 细胞的培养方式:
回到 ExPASy 中 NK-92 细胞详情页,除了 ATCC 外,我们也会看到多种细胞资源库,比如 BCRC、DSMZ:
如果 ATCC 没有你想查询的信息,我们也可以进入 DSMZ(德国菌种保藏库):
可看到该细胞具体的培养信息及免疫信息等,对做流式筛选的同学非常有帮助,点开 image,即可看到该细胞显微镜下的形态。
2、Cell Culture Database
链接:http://cell-lines.toku-e.com/
Cell Culture Database 首页:
画面依然简洁,在搜索栏输入所需查询的细胞,比如 A549,检索如下:
大家可以看到该细胞针对不同抗生素的不同耐性,一般我们在筛选稳定株的时候都会选择 puromycin 和 G418;我们可以看到不同的质粒,该细胞针对同一种抗生素会有不同的筛选浓度,小编建议大家选择出现频率最多的那个浓度(1 μg/ml )作为参考浓度,如果不放心的话也可以在该浓度范围多摸两个梯度,有效节省药筛时间。
另外,为了能让大家更详尽的了解这两个工具的使用和特点,我们制作了《细胞查询工具详解》视频:
https://v.qq.com/x/page/s0602bskm3t.html
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