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体内+体外基因调控,高分paper手到擒来

人阅读 发布时间:2020-07-22 14:59

随着生物科学技术的发展,进行离体细胞和在体的功能验证已成为高分文章的必要组成部分,在进行一系列的验证实验时常用到一些表达工具,今天就来聊聊这其中的两种病毒工具:腺相关病毒(AAV)和慢病毒(LV)。

AAV源于非致病的野生型腺相关病毒,具有安全性好、宿主细胞范围广、免疫源性低、在体内能长时间表达外源基因等特点,是进行体内验证的不二之选。慢病毒载体(LV)主要用于体外转基因研究。LV具有可感染分裂和非分裂细胞、转移基因片段容量较大、目的基因表达时间长、不易诱发宿主免疫反应等优点。

利用LV进行细胞中的基因功能验证,用AAV在动物体内进行功能验证,两者功能相互印证,我们便可以继续往下开展详尽的机制研究。下面我们以一篇文章为例,来看看如何应用LV和AAV做一篇高分文章。

 

文章名:TRIB3 Interacts with Beta-catenin and TCF4 to Increase Stem Cell Features of Colorectal Cancer Stem Cells and Tumorigenesis.

IF:20.773

作者:胡卓伟(北京协和医院)

病毒工具:LV,AAV

 

简要背景:Wnt信号β-actin蛋白的激活有助于结直肠癌的发生。tribbles pseudokinase 3 (TRIB3)的表达在一些结直肠肿瘤中升高,并与不良预后相关。作者对TRIB3是否通过与Wnt信号通路相互作用促进CRC细胞的干细胞特性和肿瘤发展进行了研究。

 

方法:在C57BL/6J-Apc Min /J小鼠体内注射( Apc Min /J-Trib3 KD )AAV和对照(Apc Min /J-Ctrl)AAV,在BALB/c体内利用AAV过表达TRIB3,利用AAV-shRNA敲低β-catenin蛋白。对这些小鼠用右旋糖酐硫酸钠(DSS)诱导大肠杆菌相关癌症,并收集肠组织,通过组织学、基因表达谱、免疫组织化学和免疫荧光分析。利用LV分别对LGR5阳性和LGR5阴性HCT-8细胞、CRC细胞进行TRIB3敲低或过表达并进行成球分析。双荧光素酶报告、染色质降水、免疫荧光和免疫印迹分析分析TRIB3与Wnt信号β-catenin的关系,并测试肽P2-T3-A6的抑制剂作用。

 

主要结果:C57BL/6J-Apc Min /J小鼠注射AAV 1周后,TRIB3敲低组的结肠中检测到TRIB3表达的降低,6周后对照组的结直肠中形成肿瘤而敲低组中未见肿瘤形成,且敲低组的存活率高于对照。但最后结直肠肿瘤的发生率没有差异,表明敲低TRIB3延缓了结直肠癌的发生。敲低组中,Wnt信号通路中β-catenin调控的基因表达更低,对照组中,肿瘤内TRIB3和β-catenin的表达较癌旁组织高,且发现两者在肿瘤中共定位。Trib3过表达的BALB/c小鼠肿瘤比对照更重,敲低actin后不但减轻了肿瘤,而且恢复了由过表达TRIB3引起的变化,表明β-catenin对Trib3的促肿瘤作用至关重要。


 

 

图1.C57BL/6J-Apc Min /J体内AAV过表达TRIB3促进结直肠癌发展,干扰β-actin一直结直肠癌发展。

 

利用LRG5对HCT-8细胞进行流式分选,发现LRG5阳性细胞TRIB3表达高于LRG5阴性细胞,LRG5阴性细胞中过表达TRIB33可以增加直肠癌干细胞(CCSC)标记基因的表达,LRG5阳性细胞中敲低TRIB3则降低了CCSC标记基因表达。肿瘤源性球状体的形成代表着CSCs或具有干细胞相关特征的细胞的富集,利用C57BL/6J-Apc Min /J小鼠分离的CRCs通过感染不同LV建立肿瘤来源的球形培养体系,发现TRIB3过表达促进肿瘤球形成和传代,TRIB3缺失抑制这一过程,TRIB3过表达并缺失β-catenin限制了这种效果,表明TRIB3通过β-catenin发挥这些促进作用。用相应LV感染HCT-8后得到了相同的结果。这表明TRIB3增强了直肠癌细胞的干性特征。
 

 

图2.LV体外过表达TRIB3增强CRC细胞干性,干扰TRIB3或β-actin抑制CRC细胞干性

 

Co-ip和GSTpull-down证明TRIB3和β-actin互作,并通过TRIB3与TCF4的相互作用使三者形成复合体,TRIB3通过使β-catenin蛋白和TCF4接近从而稳定β-catenin- TCF4复合物并增强其转录活性,从而增强Wnt信号中β-catenin调控蛋白的表达活性。

TRIB3过表达的小鼠中敲低β-catenin后TRIB3表达下调,Wnt刺激后的CRC细胞中TRIB3表达上调,表明β-catenin可能对TRIB3起积极的反馈调节作用。双荧光素酶表明β-catenin和TRIB3启动子区域作用,CHIP实验证明TCF4与TRIP3启动子区域结合,表明TRIP3是β-catenin-TCF4转录调控的靶点。

计算机预测到多肽T3A6与TRIB3有良好亲和力,将细胞穿透肽P2与T3A6融合成P2-T3A6,融合多肽与TRIB3亲和力增强,P2-T3A6扰乱TRIB3与β-catenin和β-catenin与TCF4的相互作并降低TRIB3在CRC和HCT-8细胞中的表达。P2-T3A6通过加速降解和抑制转录的方式下调TRIB3的表达,可以通过抑制TRIB3与β-catenin互作抵消crc细胞的干性。

体内实验和HCT-8细胞实验表明,P2-T3A6并不干扰β-catenin与其他互作蛋白的作用,P2-T3A6处理8周大的小鼠,与对照相比,肿瘤结节减少,小鼠存活率升高,且未对正常小鼠的心、肺、肝、肾、脾、结肠组织造成明显的组织病理学改变,也未影响正常小肠细胞的增殖或诱导细胞凋亡。这表明P2-T3A6是一种很有前景的CRC治疗先导化合物。


 

3.多肽P2-T3A6可有效抑制结直肠癌发展

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